量化細胞過程如何產生組織動力學多尺度分析系統(tǒng)

細胞產生組織動力學多尺度量化分析系統(tǒng)

背景：

細胞在發(fā)育過程中相互作用、分裂、重新排列和改變形狀以構建器官。現(xiàn)代顯微鏡和計算機技術可以跟蹤活生物體中整個器官的每個細胞。然而，要了解細胞的復雜編排如何導致器官形狀良好，研究人員需要工具來幫助存儲和分析生成的大量數(shù)據(jù)。還需要工具以簡單靈活的方式可視化和量化復雜的細胞行為。

在其發(fā)育過程中，果蠅的翅膀被分成不同的區(qū)域，這些區(qū)域被稱為靜脈的管狀支撐物隔開。在發(fā)育早期，靜脈細胞與相鄰細胞無法區(qū)分，但在后期階段，靜脈細胞會變成不同的形狀。靜脈也變得更窄，這被認為是由于靜脈細胞數(shù)量下降所致。然而，尚未詳細研究細胞引起這些變化的行為方式。

flexcellminer能夠使用戶能夠存儲大量關于細胞的數(shù)據(jù)并分析細胞如何共同塑造器官。然后使用該系統(tǒng)識別翅膀發(fā)育后期的靜脈細胞，并及時向后跟蹤它們以揭示它們在早期階段的位置。這表明靜脈變得更窄和更長，因為構成靜脈的細胞比其他區(qū)域的細胞收縮得更多。

然后使用flexcellminer顯示靜脈細胞特別重新排列和伸長以產生更薄的區(qū)域，而細胞數(shù)量由于細胞分裂而略有增加。這些結果表明，負責使靜脈伸長和變窄的細胞行為可能與之前假設的不同。

flexcellminer可用于未來的研究，以幫助理解影響細胞在翅膀發(fā)育過程中如何在靜脈中表現(xiàn)的分子信號。該工具包現(xiàn)在還可用于探索其他生物體其他器官發(fā)育所涉及的變化。

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