藥明康德合作伙伴 Adaptive Biotechnologies 宣布在《自然》子刊《Nature Genetics》上發(fā)表創(chuàng)新型研究論文，結(jié)果證明可提供一種潛在的新穎方法診斷慢性病毒感染。

藥明康德合作伙伴 Adaptive Biotechnologies 在《Nature Genetics》上發(fā)表論文，介紹診斷病毒感染的新方法（圖片來源：《Nature Genetics》）

Adaptive Biotechnologies 是高通量測序領(lǐng)域的先驅(qū)性公司和領(lǐng)軍企業(yè)之一，其專長于結(jié)合生物信息學來鑒定分析 T 細胞和 B 細胞受體。這家公司的 immunoSEQ 平臺幫助科研人員在腫瘤學、自身免疫疾病、傳染病和基礎(chǔ)免疫學等領(lǐng)域展開前沿研究。以服務(wù)或試劑盒形式，immunoSEQ 測定方法可以高度精細地從單個樣品中鑒定分析數(shù)百萬個 T 細胞和 B 細胞受體。該 immunoSEQ 平臺分析工具可提供定量、可重復(fù)的測序結(jié)果，加上其強大的訪問功能以及易于使用的特性，Adaptive 免疫測序平臺的準確性和靈敏度優(yōu)勢已經(jīng)逐步入駐世界各地的實驗室，推動癌癥和其他免疫介導(dǎo)疾病的突破性研究；同時，該公司也將免疫測序發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)化為臨床診斷和治療手段，以改善患者的護理水平。

Adaptive 結(jié)合生物信息學鑒定免疫細胞受體分析（圖片來源：Adaptive 官網(wǎng)）

這篇題為“Immunosequencing identifies signatures of cytomegalovirus exposure history and HLA-mediated effects on the T cell repertoire”的文章正是描述了 Adaptive 的計算生物學家如何使用該公司的 immunoSEQ 平臺和數(shù)據(jù)集，通過免疫測序手段來確定分析 T 細胞受體譜系，最終用于診斷人類巨細胞病毒（CMV）感染的暴露狀態(tài)。

Adaptive 的這項研究是由 Fred Hutchinson 癌癥研究中心部分資助的。研究共同作者選擇了 CMV 進行原理驗證實驗，這是因為該疾病約占成年人慢性病毒感染的 30%？90%，并被廣泛研究后建立成為公眾人群 T 細胞應(yīng)答的模型系統(tǒng)。使用公共數(shù)據(jù)，Adaptive 的研究團隊分析了 666 名受試者核心隊列的 T 細胞受體全譜系，以及另外 120 名受試者的獨立驗證隊列。研究小組制定了一個統(tǒng)計計算框架，通過 CMV 感染狀態(tài)對受試者進行分類，然后高精度確認了免疫測序方法可被用于診斷 CMV 的感染狀態(tài)。此外，該團隊使用這種方法證明它在預(yù)測受試者的人類白細胞抗原（HLA）等位基因方面也表現(xiàn)良好，表明該方法可用于識別暴露于其他病原體的生物標志，甚至疫苗接種狀態(tài)。

Adaptive 的聯(lián)合創(chuàng)始人兼創(chuàng)新主管 Harlan Robins 博士（圖片來源：Adaptive 官網(wǎng)）

Adaptive Biotechnologies 的聯(lián)合創(chuàng)始人兼創(chuàng)新主管 Harlan Robins 博士說道：“我們認為通過讀取 T 細胞記憶來推斷病原體暴露歷史的方法具有令人興奮的潛力。這是一個重要步驟，我們旨在將免疫測序驗證為針對各種慢性病毒感染的高敏感度、高特異性和高效益的診斷方法。”（生物谷 Bioon.com）

原文出處：

Emerson RO et al.Immunosequencing identifies signatures of cytomegalovirus exposure history and HLA-mediated effects on the T cell repertoire，Nat Genet.(2017).DOI：10.1038/ng.3822.