古代“口香糖”揭示人類基因組和口腔微生物組

《自然-通訊》本周發(fā)表的一項研究A 5700 year-old human genome and oral microbiome from chewed birch pitch從一個被咀嚼過的樺樹瀝青樣本中得到了一名5700年前丹麥人的全部基因組。對樺樹瀝青中含有的植物、動物和微生物DNA進行分析還揭示了這位個體的口腔微生物組和可能的飲食來源。

樺樹瀝清由樺樹皮加熱后產(chǎn)生，自中更新世（約76萬-12.6萬年前）開始一直被用作膠粘劑。考古遺址中曾發(fā)現(xiàn)過小塊的樺樹瀝清，上面通常含有牙印，顯示出這些物質(zhì)曾被咀嚼過。

丹麥哥本哈根大學的Hannes Schroeder和同事對樺樹瀝清樣本中的人類DNA進行測序，確定這名個體為女性；根據(jù)多個基因的遺傳變異發(fā)現(xiàn)，她可能有著深色的頭發(fā)、黝黑的肌膚、藍色的眼睛。作者認為，相較于斯堪的那維亞中部的狩獵采集者，她與歐洲大陸的西方狩獵采集者的親緣關(guān)系更為接近。研究人員還對樺樹瀝清中發(fā)現(xiàn)的非人類古代DNA進行了分析，檢測到了具有口腔微生物特征的細菌物種，包括一些已知的病原菌，如與牙周病有關(guān)的牙齦卟啉單胞菌（Porphyromonas gingivalis）。此外，測得的DNA序列還能對應一些植物和動物，如榛子和野鴨，作者認為這可能是之前一餐的殘留。(世聯(lián)博研(Bioexcellence)世聯(lián)博研Bioexcellence）

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