近日，美國(guó)加州理工學(xué)院研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種新的高通量空間轉(zhuǎn)錄組成像方法——并行連續(xù)熒光原位雜交par-seqFISH（parallel sequential fluorescence in situ hybridization）技術(shù)，能夠在單細(xì)胞水平鑒定和觀察微生物基因表達(dá)譜和微尺度環(huán)境中的空間信息，同時(shí)利用成像系統(tǒng)對(duì)不同菌落核仁長(zhǎng)度、染色體拷貝和核糖體水平等生長(zhǎng)指標(biāo)進(jìn)行監(jiān)測(cè)。

研究人員利用par-seqFISH對(duì)銅綠假單胞菌的生物膜形成過(guò)程進(jìn)行了研究，證實(shí)其能夠解析菌群在浮游生長(zhǎng)狀態(tài)下代謝和毒性相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄水平的動(dòng)態(tài)變化，以及固著生長(zhǎng)過(guò)程（生物膜）中在空間水平上的代謝異質(zhì)性，揭示了微生物種群在微環(huán)境空間中存在的復(fù)雜動(dòng)態(tài)。研究結(jié)果表明par-seqFISH技術(shù)能夠?yàn)槲⑸飫?dòng)態(tài)變化與生長(zhǎng)調(diào)控機(jī)制研究提供了新的工具，并為抗菌藥研發(fā)及抗生素耐藥性研究提供新的視角。

相關(guān)研究成果發(fā)表在《Science》雜志上，論文標(biāo)題為“Spatial transcriptomics of planktonic and sessile bacterial populations at single-cell resolution”(生物谷世聯(lián)博研Bioexcellence）

小編推薦會(huì)議 2021 （第四屆）單細(xì)胞多組學(xué)研究與臨床應(yīng)用峰會(huì)

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